有限合伙企业的所得税计算涉及合伙企业本身和合伙人两个层面，具体如下：
一、合伙企业层面
根据《关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》（财税[2008]159号），有限合伙企业 本身不缴纳企业所得税，而是实行“先分后税”原则，即利润穿透至合伙人，由合伙人分别缴纳所得税。 
二、合伙人层面
合伙人的所得税根据其身份（自然人、法人或其他组织）和所得性质（经营所得、股息红利等）分别计算：
1. 自然人合伙人
经营所得：
适用5%-35%超额累进税率（个体工商户税率），按年计算。
计算公式：
应纳税额 = 应纳税所得额 × 税率 - 速算扣除数
（应纳税所得额 = 合伙企业利润 × 分配比例 + 其他经营所得）
注：若合伙企业从事股权投资，部分地区（如上海）按35%税率征收。
股息、红利所得：
适用20%比例税率（按“利息、股息、红利所得”项目）。
股权转让所得：
部分地区按“财产转让所得”20%税率，部分地区按5%-35%累进税率（需咨询当地税务政策）。
2. 法人合伙人（公司或其他组织）
- 取得的利润并入其应纳税所得额，按 25%企业所得税税率（或优惠税率）计算。
- 若合伙企业投资上市公司分红，法人合伙人可享受免税政策（《企业所得税法》第26条）。
3. 其他合伙企业（如GP为合伙企业）
利润继续穿透至最终自然人/法人合伙人，按上述规则计税。
三、其他注意事项
税务申报：
- 合伙企业需填报《个人所得税生产经营所得纳税申报表》（自然人合伙人）或《企业所得税申报表》（法人合伙人）。
- 自然人合伙人通常由合伙企业代扣代缴或自行申报。
地方差异：
部分地区对股权投资类合伙企业的自然人合伙人执行20%税率（如西藏、新疆），需以当地政策为准。
亏损处理：
合伙企业的亏损不得抵扣合伙人其他收入，仅可结转以后年度抵减同类所得。
示例计算
假设某有限合伙企业年度利润500万元，分配比例如下：
- 自然人合伙人A（经营所得）：60%
- 法人合伙人B：40%
自然人合伙人A：
应纳税所得额 = 500万 × 60% = 300万
按35%税率计算：300万 × 35% - 6.55万（速算扣除数） ≈ 98.45万元
法人合伙人B：
应纳税所得额 = 500万 × 40% = 200万
按25%税率计算：200万 × 25% = 50万元
建议结合具体业务类型和地区政策进行税务筹划，必要时咨询玖邀开业专业机构。
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