有限合伙企业税务处理遵循“税收穿透”原则（企业不缴所得税，由合伙人纳税）与法定税种结合的模式，具体税种及缴纳规则如下： 一、企业主体层面缴纳的税种 增值税 征税范围：销售货物、提供服务（如咨询/租赁）、转让金融资产等经营活动。 税率差异： 一般纳税人：6%（服务）、9%（运输）、13%（货物）； 小规模纳税人：3%（现减按1%征收，月销售额≤10万元免征）。 附加税费 以增值税为计税基础，包括： 城建税（7%/5%/1%）、教育费附加（3%）、地方教育附加（2%）。
二、合伙人层面缴纳的税种（“先分后税”原则） 自然人合伙人 经营所得：按5%-35%超额累进税率缴纳个税（适用于企业利润分配）； 股息红利：按20%税率缴个税（若合伙企业持股其他公司）； 股权转让所得： 争议焦点：适用20%财产转让税率 或 5%-35%经营所得税率（各地执行不一）。 法人合伙人 分得利润并入自身应纳税所得额，按25%缴企业所得税（亏损不可抵减）。 外资合伙人 非居民企业：预提10%企业所得税（若适用税收协定可减免）。 三、高频税务风险提示 1.税率适用争议：股权转让所得若被认定为“经营所得”，自然人合伙人税率最高跳升至35%； 2.核算要求：2025年起权益性投资禁止核定征收，必须查账（发票/账簿不全将面临处罚）。 3.申报时效：年度终了后3个月内需完成合伙人所得税分配申报:。 四、地区政策差异示例 海南自贸港：对创投类有限合伙的自然人LP，直接投资所得免征个税^[政策更新]^； 上海临港新片区：金融类合伙增值税附加减半征收（2025年延续）^[地方财政]^。 合规建议： 签订合伙协议时约定税务承担方式（如GP代扣代缴条款）； 股权转让前咨询当地口径（如深圳按20%征收，北京需提交“非经营行为”说明）。 （注：实际税负需结合业务结构、地域政策及合伙人性质综合测算） |
