“差额纳税”是一种特殊的计税方法，主要应用于增值税领域。它的核心特点是纳税人在计算应缴纳的增值税时，不是以取得的全部销售额（全额）作为计税依据，而是允许扣除规定项目的支付金额（成本）后，仅就差额部分计算缴纳增值税。
简单理解就是：应纳税额 = (销售额 - 允许扣除的支付额) × 适用税率
它与“全额纳税”（应纳税额 = 销售额 × 适用税率）形成对比。 
差额纳税的关键特征和要点
允许扣除特定项目： 这是差额纳税的核心。税法明确规定了哪些项目可以在销售额中扣除。常见的可扣除项目包括：
- 支付给分包方的款项： 例如，建筑服务总包方扣除支付给分包方的分包款。
- 支付的土地或不动产购置价款： 例如，房地产开发企业销售自行开发的房地产项目，扣除受让土地时向政府部门支付的土地价款；一般纳税人销售其取得（不含自建）的不动产，扣除该项不动产购置原价或取得时的作价。
- 支付的金融商品买入价： 例如，转让金融商品（股票、债券、外汇等），销售额扣除买入价后的余额为销售额。
- 支付给劳务派遣员工的工资、福利、社保及住房公积金： 例如，劳务派遣公司提供劳务派遣服务，可以选择扣除支付给员工的工资、福利、社保及住房公积金后的余额为销售额。
- 代收转付或代垫的政府性基金、行政事业性收费： 例如，某些经纪代理服务。
- 支付给境外单位的服务费、无形资产购置费（在境内发生应税行为时）： 例如，国际货物运输代理服务等。
特定的行业或业务： 差额纳税政策通常适用于税法明确规定的特定行业或特定类型的业务活动，如上面提到的建筑服务、金融商品转让、房地产销售（特定情况）、劳务派遣、经纪代理服务、融资租赁、旅游服务、人力资源外包服务、安全保护服务、航空运输销售代理服务等。
计税方式的选择（有时）： 对于某些业务（如劳务派遣），纳税人可能可以选择全额纳税（按一般计税方法）或差额纳税（按简易计税方法），选择差额纳税通常对应较低的征收率（如5%）。
发票开具的特殊性： 采用差额纳税方式时，发票开具有特殊规定：
- 纳税人自行开具增值税发票时，通过新系统中的差额征税开票功能开具，发票上会分别显示销售额和扣除额。
- 小规模纳税人（除其他个人外）销售其取得的不动产适用差额征税的，需要由税务机关代开增值税发票。
- 对于不得开具增值税专用发票的部分（例如扣除部分对应的金额），通常只能开具普通发票。
差额纳税的主要目的和优势
- 避免重复征税： 这是最根本的目的。在存在多层分包、转手交易或需要支付大额特定成本（如土地价款）的情况下，如果按全额征税，会导致对同一增值额在不同环节被多次征税。差额纳税允许扣除支付给上游的成本，使得最终只对本环节实际产生的增值额征税，更符合增值税“道道征收、增值征税”的原理。
- 降低特定行业税负： 对于成本占比较高的行业（如建筑业、房地产业、金融业、人力资源服务业等），差额纳税能显著降低其实际税负，促进这些行业的发展。
- 简化部分业务的税收处理： 对于某些难以准确核算增值额或成本的项目（如金融商品转让），差额纳税提供了一种相对简便的计算方法。
举例说明
房地产企业销售自行开发项目：
- 差额销售额 = 1000万 - 400万 = 600万元
- 应纳增值税 = 600万 × 9% = 54万元 (假设适用9%税率)
- （如果不允许差额纳税，则需按1000万×9%=90万纳税，包含了土地价款的重复征税）
建筑总包方：
- 差额销售额 = 500万 - 200万 = 300万元
- 应纳增值税 = 300万 × 9% = 27万元 (假设适用9%税率)
- （分包方就其200万收入缴纳增值税，总包方仅就其增值的300万缴纳，避免了500万全额重复征税）
劳务派遣公司（选择差额纳税）：
- 应纳增值税 = 10万 × 5% = 0.5万元 (简易计税征收率5%)
重要提示
- 政策复杂且具体： 差额纳税的具体适用范围、扣除项目、计算方法、发票开具规则等都有非常详细和具体的规定，且政策可能调整。实际应用时务必查阅最新的增值税法规、财税文件和相关行业规定。
- 区分不同计税方法： 要明确区分“差额纳税”（通常是简易计税的一种）和“一般计税方法”（凭进项发票抵扣销项税额）。两者都是增值税的计税方式，但规则不同。
- 咨询专业人士： 企业在判断自身业务是否适用差额纳税以及如何正确操作时，强烈建议咨询专业的税务师或会计师，确保合规并充分利用政策。
总结来说，差额纳税是增值税制度下为解决特定业务（如多层交易、大额成本扣除）中重复征税问题而设计的一种计税方法，允许纳税人扣除规定的支付金额后，仅就差额部分计算缴纳增值税。 它主要应用于建筑业、房地产业、金融业、人力资源服务业等特定行业。 | 
