关于小规模纳税人开具的1%和3%增值税专用发票（专票），对方（一般纳税人）进行进项抵扣的规则和操作流程如下： 
核心原则：
- 按票面税额抵扣： 无论小规模纳税人开具的是1%还是3%的专票，对方（一般纳税人）均按照发票上注明的增值税税额进行抵扣。
- 凭票抵扣： 增值税专用发票是法定的抵扣凭证。只要取得的专票合法有效（项目齐全、信息正确、与实际交易相符等），就可以抵扣。
具体操作步骤（对于取得专票的一般纳税人）：
- 取得发票： 收到小规模纳税人开具的1%或3%增值税专用发票的抵扣联。
- 发票勾选确认：
- 在规定的勾选期内（通常是申报期前），找到这张发票信息。
- 勾选该发票，选择用于抵扣，并进行确认签名（部分系统可能自动确认）。
- 填写增值税纳税申报表：
- 在**《增值税及附加税费申报表附列资料（二）》（本期进项税额明细）** 中填写抵扣信息。
- 具体栏次：
- 通常将专票的税额填入第1栏 “（一）认证相符的增值税专用发票” 或 第2栏 “其中：本期认证相符且本期申报抵扣”。
- 系统会根据勾选确认的数据自动生成这部分信息，纳税人需要核对准确。
- 申报抵扣： 在申报期内，通过电子税务局提交完整的增值税纳税申报表。系统会根据申报表数据，允许抵扣勾选确认的进项税额。
关键点说明：
- 税率差异不影响抵扣规则： 小规模纳税人开1%还是3%专票，是开票方根据其适用的征收率（及是否享受优惠）决定的。对于收票方（一般纳税人） 而言，抵扣规则完全一样：只看票面税额。
- 1%税率是优惠征收率： 小规模纳税人适用3%征收率的应税销售收入，目前可享受减按1%征收率征收增值税的优惠政策（政策延续至2027年底）。这是国家给予小规模纳税人的优惠。一般纳税人取得这种发票，抵扣的就是按1%计算出来的税额。
- 3%税率的情况：
- 小规模纳税人如果放弃1%的减征优惠，可以开具3%的专票（开具3%专票意味着放弃享受该笔收入的1%优惠）。
- 某些特定应税行为或特殊规定下，小规模纳税人可能直接适用3%征收率（如销售不动产等）。
- 一般纳税人取得3%专票，抵扣的就是按3%计算出来的税额。
- 抵扣金额计算： 税额 = 发票上“金额”栏 × 税率（1%或3%）。这个税额在发票上已清晰列明，无需收票方另行计算。
- 与普通发票/免税发票的区别：
- 小规模纳税人开具的增值税普通发票，一般纳税人不能抵扣进项税额（除特定情况如农产品收购等）。
- 小规模纳税人开具的免税发票（例如销售农产品等适用免税政策），一般纳税人也不能直接抵扣（但可按计算抵扣等特殊规定处理）。
总结：
对于一般纳税人来说，从小规模纳税人处取得的增值税专用发票，无论是1%税率还是3%税率，其进项税抵扣的操作流程完全相同：
抵扣金额就是发票票面注明的增值税税额。 开票方适用1%还是3%的征收率，只影响开票方缴纳多少税款，不影响收票方的抵扣方式和可抵扣金额（即票面税额）。
重要提示：
- 政策时效性： 小规模纳税人1%的优惠征收率政策是有期限的（当前执行至2027年12月31日），未来是否延续请关注最新政策。
- 开票资格： 并非所有小规模纳税人都能自开专票。部分行业或特定纳税人可能需要到税务机关代开专票。无论自开还是代开，专票的抵扣效力相同。
- 合规性： 务必确保交易真实、发票信息准确无误，否则可能涉及虚开发票风险，导致无法抵扣甚至面临处罚。
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